学校本科、硕士、博士所含专业涵盖了人文、社会科学、自然科学、技术科学、农业科学等多个领域，包括历史学、文化学、政治学、环境科学、数学、物理学、化学、地理学、信息技术、农学、兽医学等。学校拥有三个学院和两个研究所，目前在校生人数约为1万人。

学校硬件能力较为先进，拥有现代化的教学设施和实验室，为学生提供良好的学习和研究环境。教师能力强，学校拥有一支专业化、资深的教师团队，其中大多数教师拥有博士学位，并且积极参与国内外学术交流和研究合作项目。

学校与其他国内外高校保持着广泛的合作，与欧洲多所大学建立了合作交流项目，如与奥地利格拉茨大学、芬兰约恩苏大学、挪威卑尔根大学、西班牙塔拉戈纳大学等建立了学生交换计划和联合研究项目等合作关系。此外，学校还与国内多所大学开展了学生互换和合作研究计划。

以下排名证明了南波西米亚大学在地区、全球和分部排名中的得分：
2022 年泰晤士高等教育青年大学排名（全球第 251-300 名，捷克共和国大学排名第一）
2022年泰晤士高等教育世界大学排名（第801-1000名）
THE 新兴经济体大学排名（第 251-300 名）
学科排名“生命科学”（第401-500位）
领域排名“临床、临床前和医疗保健领域”（601+）
QS大学排名EECA（第123名）