该机构成立于 1900 年，前身是敖德萨新罗西斯基国立大学医学院。成立之后，该医学院很快成为俄罗斯帝国最负盛名的医学院之一。许多著名医学家，包括诺贝尔奖获得者、II·梅奇尼科夫教授都曾在这里工作过。

在早期，医学院成功度过了俄罗斯革命初期的困难和动荡时期，并于 1922 年转变为独立自治的敖德萨国立医学院。苏联解体后，它成为独立的乌克兰共和国的敖德萨国立医科大学。

敖德萨国立医科大学由 58 个院系组成，学生人数超过 6000 人，其中包括来自不同国家的外国学生。学费以俄语、乌克兰语和英语授课。

大学设有100个临床科室，分布在敖德萨和敖德萨州的63个医疗和预防机构。大学的所有院系都有自己的网站。该网站包含乌克兰语、俄语和英语的所有学科的所有基本方法材料。学校图书馆建立了全馆图书期刊电子目录（70万种以上）和课程图书电子馆藏。已提供对电子资源的在线访问。建立了远程教育中心，以促进医生和药剂学的有效和不间断的专业发展。

大学为学生活跃的休闲创造了一切必要的条件。大学体育中心设有六个体育馆：体育比赛馆、乒乓球馆、健美操馆、艺术体操馆、健身馆、健身房和田径馆。有几个运动组：田径、篮球、手球、网球、举重、举重运动、游泳、击剑、室内足球、柔道、桑搏、国际象棋。

在乌克兰独立后，大学已成为获得 IV 级认证的领先医科大学之一。它是国际和欧洲大学协会的成员。因此，学生和专家的培训水平接近世界标准。