国立台北科技大学的生物化学与生物医学工程课程强调理论与实践的平衡，并着重培养学生进行独立研究的能力。

该研究所的教育目标是建立化学工程和相关领域的专业知识，包括生物技术、纳米技术、材料科学、半导体工艺、精细化学品、清洁生产、高分子科学、过程工程、催化剂化学、电化学工程、反应工程和环境工程。