1996年1月17日，根据NUKMA的决定，国立大学“基辅-莫希拉学院”尼古拉耶夫分校成立，并经乌克兰内阁决议（1996年7月3日）认证。

2002年3月13日，根据乌克兰内阁第112-р号令，彼得罗莫希拉尼古拉耶夫国立人道主义大学在国立大学“基辅-莫希拉学院”尼古拉耶夫分校的基础上成立。

2008年12月10日，根据乌克兰内阁第1521-р号令，彼得罗莫希拉尼古拉耶夫国立人道主义大学改组为彼得罗莫希拉黑海国立大学。

2009年，大学加入了大学大宪章和欧洲大学协会。它是唯一一所高等教育机构，于 2011 年代表乌克兰及其教学系统参加由全球 250 多所大学参加的塔卢瓦尔网络领袖会议。

2016 年 6 月 14 日，彼得罗·波罗申科总统颁布法令，彼得罗·莫希拉 BSSU 获得国立大学地位。

Petro Mohyla 黑海国立大学由 4 个机构和 6 个系组成。它提供的培训提供了成为经济学、法学、政治学、国际关系、历史、社会学和社会工作、公共管理学士和硕士学位的机会。教学人员培养医生、生态学家、程序员、语言学家、心理学家、管理人员和其他高薪专业人员。资料库包括11所大学建筑、一个拥有110,000种出版资源（世界15种语言）的图书馆；信息计算机中心和 14 个计算机课程室；健身房；学生宿舍等。

12个专业设有研究生部（其中9个专业的论文可受到5个专业学术委员会的保护）。培训以乌克兰语和英语进行。学生有机会学习法语、德语、西班牙语、波兰语、保加利亚语、韩语、中文、日语和希伯来语。

该大学被联合国教科文组织国际排名“乌克兰前100名”评为尼古拉耶夫州（地区）最好的大学。2017年5月29日，“乌克兰200强”（2016/2017）的结果在“Yevroosvita”国际项目中心（“欧洲教育”）的官方网站上公布。因此，根据活动估计，彼得罗莫希拉BSNU跻身乌克兰前50名大学行列，是尼古拉耶夫州领先的教育机构。

根据国际调查，PMBSNU 近年来在乌克兰最好的大学中名列前茅。在为学生和讲师提供的学术交流项目的质量和数量方面，它无疑处于领先地位。他们中的许多人获得了文凭，并在法国、德国、挪威和美国最好的大学接受了学徒训练。PMBSNU的15名科学家和讲师被授予美国荣誉国际科学界Phi Beta Delta的文凭和奖章。