该大学在胡斯改良主义运动（宗教改革之前）期间经历了转型；宗教改革家扬·胡斯大师当时是该大学的校长。在随后的社会和政治革命中，大学只剩下一个院系——文学院（Facultas artiumliberium），成为后来宗教改革学院的原型。

该大学分为17个学院，分别位于布拉格、赫拉德茨-克拉洛韦和比尔森，包括3个基础学科学院和14个专业学院，提供了广泛的本科、硕士和博士课程。以下是一些有关该大学的具体信息：

学校历史：

布拉格查尔斯大学的历史可以追溯到1348年查理四世皇帝建立了一个皇家学院，这是欧洲第一批大学之一。该大学的成立标志着中欧地区开始向知识产业的转型。布拉格查尔斯大学曾经是神学、法律和医学领域的重要中心，并吸引了来自中欧各地的许多学者和学生。在20世纪初期，该大学成为了捷克斯洛伐克共和国的重要教育和研究机构，今天它是世界上著名的研究型大学之一。

学校本科、硕士、博士所含专业：

布拉格查尔斯大学提供了广泛的本科、硕士和博士课程，涵盖了人文、社会科学、自然科学、医学、法律等领域。以下是该大学的一些专业：

人文和社会科学：历史、哲学、文学、语言学、社会学、政治学、心理学等。
自然科学：物理学、化学、地理学、地质学、生物学、环境科学等。
医学：医学、口腔医学、公共卫生、药学等。
法律：法律、法律历史和比较法等。

院系：

查理大学最初的四个院系是：法学院、医学院、艺术学院（哲学）和神学学院（现为天主教神学学院）。如今，查理大学拥有 17 个院系，主要位于布拉格，两所学院位于赫拉德茨-克拉洛韦，一所学院位于比尔森。

天主教神学院

新教神学院

胡斯派神学院

法学院

第一医学院

第二医学院

第三医学院

比尔森医学院

赫拉德茨克拉洛韦医学院

赫拉德茨克拉洛韦药学院

文学院

理学院

数学与物理学院

教育学院

社会科学学院

体育学院

人文学院

在校人数：

截至2021年，布拉格查尔斯大学有超过50,000名学生，其中本科生约为30,000人，研究生约为20,000人。该大学也有来自不同国家和地区的国际学生。

学校能力：

布拉格查尔斯大学在多个领域都有较强的研究能力，特别是在哲学、数学、物理学、化学、生命科学、医学、社会科学、法律和文学等领域。该大学的科研实力得到了全球认可，是世界著名的研究型大学之一。查理大学在中东欧大学中名列前三。该机构在世界排名 200-300 名中被评为最好的大学之一。