加州大学圣地亚哥分校的生物信息学和系统生物学计划围绕两个具有不同但重叠的教师和课程要求的学科轨道组织：生物信息学和系统生物学 (BISB) 和生物医学信息学 (BMI)。

加州大学圣地亚哥分校生物信息学和系统生物学专业的学生表示他们对一个方向感兴趣，但可以在学习期间随时请求切换。