新墨西哥州立大学的分子生物学课程提供生物化学、分子遗传学、分子生物学、细胞生物学、生物信息学和微生物学领域的硕士学位课程。

新墨西哥州立大学分子生物学课程的录取是基于一个本科课程，该课程基本上等同于该大学化学、生物学、农学、园艺、生物化学或微生物学本科专业所攻读的课程。入学学生需要完成研究生入学考试（一般能力）。本科缺陷课程必须以最低 B 成绩通过。