科罗拉多州立大学微生物学理学硕士课程为研究生提供现代调查微生物学、免疫学和病理学基础知识的培训机会，重点是采用多学科方法来研究问题。

微生物学、免疫学和病理学系提供采用多学科方法的卓越研究计划，并且是全国一些最优秀的生物医学研究人员的所在地，他们在高度专业化的实验室工作。他们的研究重点是了解病理学、改进诊断以及为国际重要传染病开发更有效的治疗方法、疫苗和疗法。